Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms