Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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