Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms