Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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