Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CALCOCO2Q13137 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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