Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1AQ13111 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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