Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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TRIM32Q13049 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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TRIM32Q13049 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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TRIM32Q13049 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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