Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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