Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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