Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXD4Q12950 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXD4Q12950 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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