Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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