Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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