Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms