Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms