Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU4F1Q01851 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms