Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms