Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLTCQ00610 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms