Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms