Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms