Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms