Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTTPP55157 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MTTPP55157 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MTTPP55157 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms