Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPNA1P52294 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms