Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms