Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPIAP49247 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPIAP49247 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPIAP49247 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms