Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.7 ms