Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP13P45452 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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