Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms