Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms