Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms