Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms