Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGM1P36871 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGM1P36871 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGM1P36871 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGM1P36871 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGM1P36871 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms