Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPB2P35606 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPB2P35606 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms