Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA4P35212 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms