Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5DP30049 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms