Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms