Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMBRP28336 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMBRP28336 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMBRP28336 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms