Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PEX2P28328 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PEX2P28328 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PEX2P28328 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PEX2P28328 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PEX2P28328 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PEX2P28328 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PEX2P28328 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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