Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTSSP25774 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTSSP25774 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTSSP25774 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTSSP25774 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTSSP25774 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CTSSP25774 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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