Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR1P24390 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms