Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRZ1P23471 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms