Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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