Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGS1P23219 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms