Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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EPB42P16452 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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EPB42P16452 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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EPB42P16452 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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EPB42P16452 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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EPB42P16452 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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