Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD8P13378 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms