Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FGF3P11487 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGF3P11487 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGF3P11487 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGF3P11487 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGF3P11487 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGF3P11487 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGF3P11487 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FGF3P11487 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms