Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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