Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCF2P10911 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCF2P10911 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MCF2P10911 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCF2P10911 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms