Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM10L2BP0DMW5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM10L2BP0DMW5 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms