Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX6O95503 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX6O95503 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms