Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBDO15205 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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